Subsistema para la Creación, Control y Desarrollo Automatizado de Scripts de simulaciones en LAMMPS (SimBox)

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Gianni Martínez Padrón Frank Alberto Broche Gómez Edisel Navas Conyedo Jorge Gulín González

Resumen

En el presente es cada vez más evidente la aparición de patógenos (virus, hongos, bacterias) que afectan la estabilidad y existencia de la vida humana, esto ha llevado a los científicos a la búsqueda de herramientas que permitan encontrar soluciones con mayor rapidez y confiabilidad. Los procesos químico-biológicos involucrados en la interacción entre un patógeno y el organismo humano son de alta complejidad y en muchos casos no es posible realizar experimentos in vivo sobre el estado presente de la infección y su posible evolución. En este contexto, las simulaciones por computadora son de gran utilidad pues permiten estudiar fenómenos y procesos a escalas micro y mesoscópica y realizar experimentos virtuales de procesos que son difíciles de estudiar a partir de técnicas experimentales. LAMMPS es un paquete informático que permite la modelación y simulación de procesos físico-químicos en diferentes escalas espacio-temporales. LAMMPS es particularmente útil en es el estudio de sistemas en la mesoescala y, por ende, para investigar procesos en microfluidos de interés biológico como el plasma sanguíneo. En este trabajo se propone una herramienta nombrada Subsistema para la Creación, Control y Desarrollo Automatizado de Scripts de simulaciones en LAMMPS (SIMBOX) que tiene la función de asegurar la comunicación con el simulador LAMMPS para administrar los parámetros y controlar las simulaciones que ejecute el usuario, así como llevar a cabo la automatización del proceso de desarrollo de Scripts de simulación. Para ello se estudió el proceso de negocio asociado con la gestión de simulaciones y ya sistemas existentes.

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Cómo citar
Martínez Padrón, G., Broche Gómez, F. A., Navas Conyedo, E., & Gulín González, J. (2022). Subsistema para la Creación, Control y Desarrollo Automatizado de Scripts de simulaciones en LAMMPS (SimBox). Serie Científica De La Universidad De Las Ciencias Informáticas, 15(8), 15-26. Recuperado a partir de https://publicaciones.uci.cu/index.php/serie/article/view/1130
Sección
Artículos originales